大地被起因不明的天災肆虐，遭受天災席捲的土地出現蘊含神祕能量的礦物「源石」。隨著技術進步，源石逐漸被人們投入到工業中，使文明突飛猛進，然而源石本身也造就了「感染者」的存在。
受到「源石」影響而感染礦石病的患者，由於擁有潛在的危險能力，以及死亡時帶來的擴散傳染性，因此成為了各國隔離驅逐的目標。直到一位顛覆者的出現，使越來越多感染者被納入名為「整合運動」的反抗浪潮中，他們試圖用武力去爭奪世界的公正。
當反抗浪潮越演越烈，醫療機構「羅德島」的突然介入，令整個事態向著未知發展，玩家將與羅德島的幹員一同面對史無前例的感染者暴亂。在各個勢力間遊走，發掘不為人知的內幕，抵擋感染者的瘋狂進攻。
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