二〇九五年十一月某日。
放學途中，突然受到不明一夥人攻擊的達也等人。
「給我交出聖遺物」如此威脅的一群人被達也制服，但卻沒能防止他們逃跑。
他們在逃跑中所使用的，是帶有魔法式保存機能、瓊勾玉系的聖遺物。
發現可能與 FLT 開發第三課所保管的聖遺物有關的達也，與獨立魔裝大隊・隊長的風間聯繫，得知瓊勾玉系聖遺物的出土地情報。
「飛驒高山近郊・乗鞍岳」
為了解決事件而前往當地的達也與深雪，在路上遇到了因傷倒地不起的謎之少女・高山陽菜――
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