二十年前，西域魔教入侵中原，被兩名英雄人物：趙蒙、龍霸所終止；然而，浩劫並未就此結束，就在二十年後………
明朝中葉武林紛亂，中原各派勢力雄據一方，外來強弩緊叩中國大門。江湖傳聞「一訣三歎五毒」重現武林，但知其玄妙者只存少數…東廠嚴崇英誅殺忠良，勾結海盜炎魔無天，欲號令天下；西域魔教更因二十年前的恩怨，伺機反撲中原。
此刻，各地戰亂不斷，倭寇侵擾，邊防告急、朝廷腐敗，災民四竄。眼見武林即將陷入一場空前的浩劫！
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《俠客英雄傳》中扮演的主角張知秋，是一名年約 20 出頭的潮山派三弟子。遊戲從張知秋奉師命前去參加清風莊剿寇大會開始，經歷江湖的險惡、朝庭的壓迫、前輩先人的情仇恩怨、以及神功秘笈的爭奪，其中還穿插不少與其他角色間愛情與友情的抉擇。
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