雖然 2D 玩法限制玩家只能在 X Y 兩個軸向移動,但《闇影帝國》的畫面與場景仍然是全 3D 構成的。敵人會從背景的轉角或門口朝玩家發動攻勢,或是從樓頂向下射擊;當敵人出現在玩家無法前往的深度位置時,主角武器的射線會自動校正到敵人所在的軸面,大部分的時間玩家只要按下 RT 右發射鍵開火即可。要是你不滿意自動鎖定的效果,可以使用右類比桿手動調整射線,利用雷射瞄準器的紅色光束對準你想射擊的方位。
遊戲場景切分成許多區域,往來每個區域時畫面會切換,但遊戲本身則是全然無接縫無讀取。在遊戲中按下 BACK 鍵可以開啟地圖,上面會標示出所有曾經到過的區域,如果該區域有隱藏物品,地圖上還會自動標出「?」,方便玩家取得解謎手段後再回頭尋寶。另外還可以開啟指引功能,在地圖上標示出正確的前進路線,避免玩家因迷路而卡關。要是謎題過不了,遊戲也提供了相當的提示:主角的身上帶了一把手電筒,除了照明還兼具謎題提示的效果,當手電筒的光線照在可破壞的物件上時,物件會依相對應的武器種類而發光(例如可用槍彈破壞的會呈現亮黃色、需用手榴彈炸開的會呈現綠色)。