另一方面，正在新世界海域上持續航行的草帽一伙，突然發現漂浮在海上、右臂裝著巨大兵器並負傷的Z將軍。魯夫一行人雖對那異常的兵器產生警戒，卻仍舊幫他治療；然而當Z將軍恢復意識，並發現草帽一伙是海賊時，他毫不猶豫開始對他們展開攻擊。即使草帽一伙奮力反擊，卻仍抵擋不了Z將軍對於海賊有如復仇般的狂暴攻勢。千陽號幾近全毀，草帽一伙在敵人的「惡魔果實」能力下慘敗…。偏偏前方又有海軍本部的通緝，以及脫離海軍、依然追擊草帽一伙的「青雉」。面對勁敵環伺，魯夫一行人當然不會就此放棄。如今「新世界」的命運正掌握在他們手裡，一場前所未見的殊死決鬥即將展開！
本次的電影作品在日本上映時提供了 200 萬套限量特典「海賊的寶袋」，內容包括《
航海王》第千卷的漫畫、以及結合尾田榮一郎新圖的贈品，而由於觀賞的人數比預期的高出許多，因此官方也決定將增印 200 萬冊的《
航海王》第千卷。
《
航海王電影：Z》在預售票的部分售出有 65 萬張，比起 2009 年的《海王電影版：強者天下》約增加了 50% 的銷售成績，日本媒體也相當看好本作日後的累積票房。
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